Atlantis wurde entdeckt und soll bezogen werden. Der Haken dabei ist, dass die Energie für eine Reise zurück nicht ausreicht. Das hält Dr. Weir und ihre Kollegen jedoch nicht ab, sich diesem Abenteuer zu stellen. Nachdem man sich in Atlantis eingerichtet hat, bekommt man es mit den Wraith zu tun, uralten Feinden der Antiker, die gegen sie machtlos waren. Colonel Sumner, der das Kommando über die militärischen Einheiten hält, wird gefangen genommen und stirbt wenig später. Major Sheppard übernimmt die Rettungsmission, kommt für Sumner jedoch zu spät. Dafür rettet er die außerirdische Teyla, die sich schließlich dem Team anschließt.
Der Auftakt zur neuen Serie ist gut gelungen und macht Lust auf mehr.
Simon, der Mann von Dr. Weir, wird von Garwin Sanford dargestellt, der in „Stargate SG-1“ mehrmals den Tollaner Narim spielte. Wie es sich für den ordentlichen Auftakt einer Spin-off-Serie gehört, gibt es natürlich Gastauftritte alter Recken. So erlebt man hier O’Neill und Daniel Jackson, die den Staffelstab übergeben.